Не обязательно. Чтобы изменить стандартную боёвку, достаточно найти и засунуть в проект несколько необходимых плагинов (или скриптов, зависит от мейкера) и настроить их. Графику тоже можно переделать (в пределах ограничений). Всё куда труднее, если речь идёт о более сложных манипуляциях (например, на MV нет тактической боёвки без серьёзных багов, поэтому нужно исправлять или писать с нуля, что далеко не каждый сможет... Полностью перелопатить весь интерфейс, чтобы уйти от мукерского - тоже не самая простая задача), то возникают сложности. Тут вопрос в том, что требуется от программы и зачем. Из всех движков, наверное, у мукера один из самых низких порогов вхождения.
Социальные закладки