Разница в том, что спрайты в RPG Maker имеют очень маленький размер, и использовать для них вектор просто бессмысленно. А вот для нарисования Чипсетов/тайлов, Мугшотов,Анимаций использовать вектор очень даже можно, потому что это даст хорошее качество картинки. Ну и плюс разница стилей, но тут каждому своё.