Вы всё-таки попробуйте на слое с берегами сделать дно из того же тайла, что и берега, а слои с водой (не меняйте фильтр) сделать прозрачными - покажите, что получится.
Не знаю, как в Гимпе, но в Фотошопе, если нажал один раз высветлитель, то надо кнопку (мыши) не отпускать до самого конца (со стилусом не помню, там, вроде не стоит отрывать перо от планшета... не помню). Повторное нажате кнопки - уже новое высветление. Я так вас поняла.
Или что вы имели ввиду под странностью?
Социальные закладки