Через графический редактор.

В папке локальных файлов мейкера находим папку generator. В ней - 4 файла градиентов (grad_common, grad_eyes, grad_hair, grad_skin). Открываем тот, который нужен, в графическом редакторе. Лучше сделать перед этим копию на случай всяких неожиданностей.

Увеличиваем размер холста на 4 пикселя снизу. Теперь у нас есть место для новой палитры.
Добавляем палитру снизу (рисуем или берём с другого файла - не важно).
Сохраняем с тем же названием в том же месте.